Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP34Q70CQ2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms