Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms