Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIGD3Q6B0B8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms