Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM46CQ5VWP2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM46CQ5VWP2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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