Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms