Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms