Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms