Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms