Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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