Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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