Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACKR1Q16570 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms