Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSX1Q16384 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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