Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms