Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A5Q15758 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms