Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms