Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms