Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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CNGB1Q14028 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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