Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CAPSQ13938 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPSQ13938 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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