Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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SHROOM2Q13796 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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SHROOM2Q13796 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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SHROOM2Q13796 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
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