Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms