Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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