Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms