Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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