Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NME3Q13232 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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