Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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