Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TROQ12816 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TROQ12816 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TROQ12816 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms