Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms