Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms