Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms