Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms