Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ERVFRD-1P60508 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms