Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP107P57740 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP107P57740 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP107P57740 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP107P57740 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP107P57740 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP107P57740 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms