Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms