Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TPD52P55327 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TPD52P55327 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TPD52P55327 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TPD52P55327 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TPD52P55327 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPD52P55327 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPD52P55327 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPD52P55327 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPD52P55327 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPD52P55327 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms