Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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