Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRE11P49959 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRE11P49959 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRE11P49959 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms