Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIP4K2AP48426 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms