Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA8P48165 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms