Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NBL1P41271 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBL1P41271 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBL1P41271 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBL1P41271 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms