Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDH1P40925 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MDH1P40925 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms