Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MLH1P40692 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MLH1P40692 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms