Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms