Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BMI1P35226 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BMI1P35226 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms