Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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