Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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