Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms