Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms