Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA4P13612 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms