Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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