Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM58BPP0C7Q3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms